Stichting SONECA werkt voornamelijk projectmatig en themagericht. Ze zet diverse methoden in om haar doelstellingen te bereiken. Voorbeelden daarvan zijn het organiseren van discussie- en voorlichtingsbijeenkomsten, het maken van radioprogramma’s, het houden van een inloopspreekuur, het trainen van jongeren en vrijwilligers, en het adviseren van organisaties en overheden. SONECA zoekt hierbij de samenwerking met andere organisaties.
SONECA streeft naar duurzame effecten van haar inzet. Er wordt onder andere veel aandacht besteed aan het trainen van jongeren. Jongeren doen daarmee vaardigheden op die hen in staat stellen om volwaardig deel te nemen aan de Nederlandse samenleving. Van hen wordt verwacht dat zij vervolgens hun kennis en vaardigheden inzetten om ook iets voor andere jongeren en voor de maatschappij te betekenen.
